Obavijestio je Cordoba navijače Nerazzurra o svom napuštanju San Sira neposredno uoči velikog gradskog derbija protiv Milana putem internetske stranice kluba. Kolumbijac je u Inter stigao u siječnju 2000. godine iz San Lorenza uz odštetu od 16 milijuna eura. Otad je s Nerazzurrima osvojio pet naslova u Seriji A, četiri talijanska Kupa, tri talijanska Superkupa, jednu Ligu prvaka i jedno Svjetsko klupsko prvenstvo.

Cordoba će Inter napustiti kao slobodan igrač budući mu aktualni ugovor istječe krajem lipnja, a gdje će nastaviti karijeru zasad nije poznato.

Za kolumbijsku reprezentaciju skupio je od 1997. godine 67 nastupa, a kao kapetan ju je predvodio do naslova na Copa Americi 2001. godine.