Klinika za psihijatriju Vrapče kupila je 1899. godine zemljište u ulici Oranice za potrebe ukopa preminulih pacijenata koji su se liječili u bolnici. Na groblju je bilo približno 2000 grobnih mjesta, a pokopano je oko 3.500 ljudi. Prva je na groblju sahranjena kći tadašnjeg ravnatelja Zavoda dr. Ivana Rohačeka. Osim bolesnika umrlih u "Vrapču", na bolničkom groblju pokapani su i članovi njihovih obitelji, zaposlenici bolnice, ali i umrli stanovnici Donjeg Vrapča i Kustošije. Bolesnici poginuli u bombardiranju 14. ožujka 1945., a bilo ih je 37 i devet zaposlenika, pokopani su u dvije zajedničke grobnice. Na groblju je sahranjen i ravnatelj bolnice dr. Ivo Žirovčić, jedan od pionira hrvatske psihijatrije. Također, tu je bila sahranjena i Slava Raškaj koja je umrla u bolnici Vrapče. Posmrtni ostaci nesretne gluhonijeme slikarice preneseni su u obiteljsku grobnicu kraj crkve Sv. Vida u Ozlju devedesetih godina prošlog stoljeća. Za vrijeme dok je grobljem upravljala bolnica, pacijenti su u sklopu terapije hortikulturno održavali groblje. Posljednji preminuli, Vladimir Sinković, ondje je pokopan 1976., a već iduće godine odlukom Općine Susedgrad groblje je zatvoreno. U Muzeju Bolnice Vrapče nalaze se predmeti koji su pripadali ljudima pokopanima na Bolničkom groblju Vrapče. Među njima su ogrlice, naušnice, satovi.